经济与管理学院成立于2022年，前身是1959年成立的昌吉师范学校政治教育教研组。

昌吉师范学校政治教育教研组成立于1959年，是昌吉师范专科学校最早成立的五个教学单位之一，主要承担全校的公共政治课教学。1976年适应地方教育的需要，开办历史教育教师进修中专班。1982年开办首届思想政治教育大专班。1985年随着昌吉师范学校升格为昌吉师范专科学校而更名为政治教育系，招收思想政治教育与历史教育专业专科生。为适应当时形势需要，1993年将担任公共政治课教学的教师从政治教育系分离，单独成立了马列教研室，直属校党委领导。在运行过程中因为师资、学科等问题又于1995年回归政治教育系。1999年教育心理教研室并入政治教育系，并招收了首届教育管理专业的专科生。2001年昌吉学院升格为本科院校，为适应学院升本需要开始拓展非师范类专业，将政治教育系更名为法律经济系，并招收了工业经济专业的专科生。

2002年，在昌吉师范专科学校升格为昌吉学院的背景下，政治教育系响应学院提出的“立足昌吉、面向新疆、以师范为主、多学科发展”的定位，在充分调研与论证的基础上，将政治教育系更名为经济管理系，并开始开办本科班，包括思想政治教育、公共事业管理、工商管理三个本科专业、一个工商企业管理专科专业。

为加强大学生思想政治教育工作，2005年6月学院将马列和教育心理室从经济管理系剥离，成立了社会科学部。经济管理系成为同其他大多数教学单位一样的单一承担专业教学任务的系部，下设思想政治专业教研室、公共事业管理专业教研室、工商管理专业教研室。

2008年，经济管理系新增工商管理本科专业，2013年新增财务管理本科专业，2016年新增专科专业连锁经营管理（特许连锁经营管理方向），2020年新增专科专业现代家政服务与管理，2021年新增行政管理、会展经济与管理、家政学本科专业。

2022年4月，经济管理系更名为经济与管理学院，同年新增专科专业现代物流管理。截至2023年9月，经济与管理学院现有10个专业，其中本科专业6个：公共事业管理、工商管理、财务管理、家政学、行政管理、会展经济与管理。专科专业4个：工商企业管理、连锁经营管理、现代家政服务与管理、现代物流管理。教师61人，在校学生3108人。

从1959年政治教研组成立，历经政治教育系、法经系、经济管理系到经济与管理学院的64年，为全疆——尤其是昌吉州地区培养了大批急需人才，有相当数量的毕业生陆续走上了各级各类领导岗位，为当地经济文化建设做出了应有贡献。64年间历届院领导班子和广大教职工们为经济与管理学院的发展呕心沥血，贡献了自己的青春与热血，并以精诚团结、共同进步的实际行动确立了团结、协作的优良系风，成为了经济与管理学院的一项优良传统。尤其值得一提的是政治教研组和政治教育系的奠基者李耀谦主任，将自己毕生的精力与生命奉献给了昌吉学院的教育事业，以自己的实际行动和人格魅力为后来者树立榜样。经济与管理学院领导班子为深入学习贯彻党的二十大精神，落实学校党委第二次党代会建设有区域特色的新疆一流应用型大学的精神，加快经济与管理学院高质量发展，提升服务区域经济建设和社会发展的能力，经济与管理学院将在学校党委的坚强领导下，团结带领全体教职员工，踔厉奋发，勇毅前行，有序推动学校“十四五”发展规划的落实，高质量完成学生教育、实践、毕业和就业等各项工作。