教育科学学院办学历史可追溯到1959年成立的昌吉师范学校，历经六十三年的薪火相传，逐渐形成了自己的办学特色。现有小学教育、学前教育、特殊教育、教育技术学4个本科专业和学前教育1个专科专业。学前教育专业于2016年获批校级重点专业，小学教育专业于2019年获批自治区一流本科专业，2022年获批国家一流专业建设点。目前，学院在校学生3569人，教职工68人，其中，教授2人，副教授14人；博士12人，硕士55人。近七年，学院教师共发表论文157篇，其中，核心21篇，普刊136篇；教科研课题共72项，其中，国家级1项、省部级9项、厅局级11项、院级51项；出版专著1部。
各专业学生依托专业特长和能力积极参加各级各类比赛竞赛和创新创业教育实践活动，近三年学生累计获批大学生创新创业计划项目47项，其中国家级2项、自治区级7项、校级38项；获得校级及以上奖励二百余项，其中“互联网+”大学生创新创业大赛获奖2项，国家级铜奖1项、自治区级金奖1项；“当代杯”全国幼儿教师职业技能大赛获奖51项；新疆高校信息素养大赛三等奖5项；全国师范生微课大赛获奖10项；新疆高校师范生教学技能竞赛获奖8项，其中一等奖5项、二等奖2项、三等奖1项；书画作品获奖97项等。
学院师生始终秉承“惟德惟才，笃学笃行”的校训，与现代教育同频共振，为全疆基础教育的发展贡献力量。